Программирование в биологии реферат

Обновлено: 05.07.2024

Вы когда-нибудь задумывались над идеей изучения программирования? Вы пробовали, но испытывали разочарование от огромного количества информации? Если вы ответили утвердительно на оба этих вопроса, я призываю вас повторить попытку прочитав эту статью. Информатика — один из лучших предметов для самостоятельного изучения. Все, что вам нужно, это мотивация и компьютер, подключенный к Интернету!

Ознакомьтесь с представленными ресурсами, и вскоре вы сможете стать программистом.

Изучение Основ

Возможно, вы уже знаете какой-либо язык программирования, однако я настоятельно рекомендую сделать шаг назад, чтобы сначала изучить основы информатики. Прежде чем изучать синтаксис выбранного языка программирования, вам необходимо освоить основные понятия, такие как типы данных, переменные, условные выражения, циклы, массивы, функции и т. д. Один из лучших способов сделать это — пройти бесплатный онлайн- курс введения в компьютерные науки . Вы познакомитесь со многими языками, включая C, PHP, JavaScript, SQL, CSS и HTML. Вы также узнаете, как писать/запускать программы в простой среде IDE. Этот курс является сложным первым шагом, но если вы серьезно относитесь к тому, чтобы стать программистом-биологом, полученные результат будет стоить затраченных усилий.

Выбор языка программирования

Пройдя курс, вы будете хорошо понимать основы информатики. Теперь самое интересное: выбор основного языка. Выбор языка будет зависеть от того, для чего вы планируете использовать свой новый навык. Чтобы проводить анализ научных данных или запускать простые сценарии для ускорения повторяющихся вычислительных задач, я настоятельно рекомендую Python, Ruby, Perl, Julia или R. Если вы не уверены, какой язык вам наиболее подохидт, ответьте на несколько вопросов на Best Programming Language. Потратьте некоторое время на чтение о плюсах и минусах, а также о том, насколько крута кривая обучения.

Моя рекомендация — это Python. Его проще всего изучать, он обладает обширными возможностями и имеет большое количество готовых библиотек и инструментов для работы в области биоинформатики. Например, Biopython, Galaxy и Pygr, чтобы назвать несколько. Например, если вы выберете Python, у вас будет гораздо более плавный опыт внедрения мощных программ за относительно короткое время по сравнению с C ++ или Java.

Практика, практика, практика

После того, как вы выбрали язык, необходимо непрерывно практиковаться. Если вы выбираете язык, который раньше никогда не использовали, начните с любого бесплатного интерактивного учебного пособия. В свободном доступе сейчас есть учебники по Python, Ruby, Rails, Java, SQL, Git и многим другим. Если вы выбираете python и также интересуетесь биоинформатикой, ознакомьтесь с курсом Биоинформатика для начинающих на Coursera.

Единственный способ стать лучшим биологом-программистом — это постоянно писать программы. При этом вы освоите небольшие техники, научитесь мыслить программами и в конце концов почувствуете себя достаточно уверенно, чтобы применить свои знания в решении реальных задач. Хорошей новостью является то, что существует огромное количество ресурсов, предназначенных для того, чтобы помочь вам практиковать свои навыки.

Вот некоторые из них:

    — Проблемы и алгоритмы биоинформатики — проблемы связанные с математикой

Специализация в области биоинформатики

Теперь, когда вы изучили основы, выбрали язык и усердно работали над практическими проблемами, попробуйте бесплатную онлайн- специализацию из семи курсов по биоинформатике, созданную Павлом Певзнером и Филиппом Компо. Это лучший ресурс, который я рекомендую всем, кто интересуется биоинформатикой и вычислительной биологией. Вы изучите сотни алгоритмов биоинформатики, включая выравнивание последовательностей, поиск мотивов, сборку генома, эволюционную реконструкцию дерева, скрытые марковские модели, секвенирование пептидов и многое другое. Вы также познакомитесь с инструментами секвенирования следующего поколения и другими методами вычислительной биологии. Специализация занимает 3 — 6 месяцев, поэтому она не будет отвлекать вас от основной деятельности.

Начни свой путь как программист-биолог

Информация из этой статьи может помочь вам, а может и нет — все индивидуально, однако она дает хороший вектор для движения. При этом вы сами можете регулировать интенсивность обучения. Проявив настойчивость вы в конечном итоге достигнете уровня комфорта написания программ и станете программистом-биологом. Это будет нелегко, но оно того стоит. Удачного кодирования!

Читайте также: